Depuis sa création, L'Observatoire bénéficie du soutien financier du ministère du Conseil exécutif, gouvernement du Québec et de l'École nationale d'administration publique.
Les sites L'État québécois en perspective et Les États canadiens comparés bénéficient du soutien financier du Secrétariat aux affaires intergouvernementales canadiennes (SAIC).